La disposición final de los desechos infecciosos generados por clínicas y hospitales en Santo Domingo es un tema crucial que está siendo llevado a cabo por la EPCONS junto con un aliado estratégico. Según el Ministerio del Ambiente, se ha confirmado que, si alguna institución de salud desea manejar sus propios desechos, deben seguir un proceso técnico bajo la regulación del ente correspondiente.